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公司新闻

BTN101105 5'-RACE试剂盒

发布时间:2017-10-01 11:24 |  点击次数:261

5'-RACE试剂盒说明书
产品编号:BTN101105
规格:10T
产品及特点:
研究真核基因的最基础的工作之一就是确定其转录终止位点,目前最通用的方法是5′-RACE法,RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)是Frohman发明的、通过PCR快速克隆cDNA末端的技术,它在不建立cDNA文库的前提下,利用已知cDNA序列设计引物,通过往两端延伸和扩增获得其5′-端序列。本试剂盒就是根据5′-RACE原理而开发,它具有下列特点:
1. 即开即用,客户不需要单独准备各种材料。
2. 反应条件经过精心优化,包括使用无RNase H活性的MMLV和优化的引物。
5′-RACE的原理如下图:
 
 
 
 
规格及成分:
成分 规格
MMLV逆转录酶-RI混合液
(RNase H-,200 U/μL)
10μl
MMLV Buffer-dNTP混合液 60μl
微量核酸沉淀剂 400μl
TdT(末端转移酶) 10μl
2×TdT Buffer(含dATP) 100μl
PCR MagicMix 3.0 1.5ml
5′-RACE引物A-引物B混合液 100μl
5′-RACE引物C 100μl
RNase-Free水 1ml
保存条件:
低温运输、-20℃保存、有效期一年。
自备试剂:
Poly(A) RNA(或总RNA)、基因专一性引物A、B、C、75%乙醇。注意:自备的基因专一性引物A,B,C的相对位置应该跟本手册产品介绍中的示意图一致。
使用方法:
1. 变性模板RNA:将1μg  mRNA或5μg总RNA加入到一个RNase-free的PCR管中,补RNase-Free水到9μL,65℃保温5分钟后短暂离心,立即放冰上待用。如果RNA浓度偏低,体积超过9 μL,可以使用本公司的核酸浓缩剂(需另购,产品编号为BTN110801)浓缩到所需的体积。
2. 设置RT反应(用户可以根据需要设阴性对照):在上步的含变性后的RNA模板的PCR管中,按顺序加入:
成分 用量
自备的基因专一性引物A(10μM) 4μl
MMLV Buffer-dNTP混合液 6μl
MMLV逆转录酶-RI混合液 1μl
合计 20μl
3. 37℃保温60分钟, 42℃保温30分钟, 50℃保温10分钟,最后75℃保温10分钟使逆转录酶变性。
4. 短暂离心5秒后待用。
5. 在PCR管中加入40 μL微量核酸沉淀剂(本产品含不溶的核酸助沉剂,用前需要充分摇匀再取用),震荡混匀。
6. 室温12000 rpm离心15分钟,小心吸弃上清。
7. 加入1mL 自备75%乙醇,室温12000 rpm离心5分钟,小心吸弃上清。
8. 短暂离心数秒,小心吸弃残留液体后,稍微晾干后加入10μL RNase-free水,充分吹打溶解,得到cDNA溶液。注意:为保证加尾效率,溶解cDNA的RNase-free水最好不要超过10 μL。
9. 加尾反应:在10μL cDNA溶液中加10μL 2×TdT Buffer(含dATP)和1μL TdT酶,轻柔吹打混匀。
10. 37℃保温15分钟进行加尾反应,然后75℃保温3分钟灭活末端转移酶。
11. 加入0.5 mL RNase-free水稀释加尾反应体系。此稀释液将作为PCR的模板。
12. 第一轮PCR:用不同量的稀释后的加尾反应液设置PCR反应(样品组最好设用量梯度,单位:μL)。
成分 梯度1 梯度2 梯度3 梯度4
PCR MagicMix 3.0 25 25 25 25
自备基因专一性引物B(10 μM) 2.5 2.5 2.5 2.5
5′ RACE引物 A-引物B混合液 2.5 2.5 2.5 2.5
稀释后的加尾反应液 1 5 10 15
RNase-free 水 19 15 10 5
合计 50 50 50 50
13. 按下列条件进行 PCR(注:应根据实际情况选择适当的退火温度)。
第 1 次循环:94℃ 5 分,48-52℃ 2 分,72℃ 4 分
第 2-30 次循环:94℃ 40 秒,52-60℃ 1 分,72℃ 3 分
最后延伸:72℃ 15 分
14. 取10-20μL PCR产物进行琼脂糖电泳电泳检查PCR结果,如果一条清晰的条带,则可以不做后续的第二轮PCR,而直接进行 DNA 测序或TA克隆。
15. 第二轮PCR:如果第一轮PCR没有一条清晰的条,则带从4管PCR产物中各取1μL分别加入到20μL RNase-free水中进行稀释,然后各取1μL分别作为4管第二轮PCR的模板:
成分 用量
第一轮 PCR 产物的稀释液 1μl
PCR MagicMix 3.0 25μl
5′RACE 引物 C 2.5μl
自备基因专一性引物 C(10 μM) 2.5μl
RNase-free 水 补水至50μl
合计 50μl
16. 按下列条件进行 PCR:第 1-30 次循环(94℃ 40 秒,52-60℃ 1 分,72℃ 3分),最后延伸:72℃ 15 分
17. 取10-20μL第二轮 PCR 产物进行琼脂糖电泳,一般都会有一个样品有清晰的条带出现,则可以直接进行DNA测序或TA克隆。

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