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BTN160903 可调式易错PCR试剂盒
发布时间:2017-10-01 17:44 | 点击次数:
可调式易错PCR试剂盒说明书
规格:100T
产品及特点:
易错PCR(error-prone PCR)是利用Taq DNA多聚酶不具有3′→5′校对功能的特性,在一定条件下(如不同的dNTP浓度、Mg浓度和MnCl2存在)能够按较高的机率引入随机引入突变。如果有适当的选择方法,则可从构建的突变库选出所需突变体。
本产品是在本公司的易错PCR试剂盒基础上改进而得,本产品具有下列特点:
1. 即开即用,十分简单方便,尤其在生物制药和酶学研究领域显示出了它的优越性。
2. 配方经过精心优化,实验人员在一定范围内可以控制突变率,一轮PCR的突变率范围在2-8突变/1000bp,更高的突变率可以通过多轮PCR达到。
3. 可用于连续易错PCR(sequential error-prone PCR),只需把上一次易错PCR的产物用作下一次易错PCR的模板即可,使每一次获得的小突变累积而产生重要的有益突变。
4. 可以扩增的DNA片段更长,达到3kb,对于3kb以上的产物,建议分段扩增。
规格及成分:
成分 | 规格 |
Taq DNA聚合酶(5U/μL) | 100μl |
易错PCR Mix 2.0,10× | 300μl |
易错PCR专用dNTP 2.0,10× | 300μl |
易错PCR专用MnCl2 | 300μl |
易错PCR专用dGTP | 300μl |
超纯水 | 1ml |
说明书 | 1份 |
保存条件:
低温运输,-20℃保存, 有效期为一年。
自备试剂:
引物、DNA模板。
使用方法:
1. 将模板DNA稀释到1ng/μL。将引物稀释到10uM。注意:引物是决定易错PCR成败的关键因素,设计引物时要保证其Tm在70℃,长度在25-30nt之间,GC含量在45%-60%之间,3端GC含量低,并且没有发夹结构。
2. 根据每1000bp的预期突变数按下表确定易错PCR的反应条件中MnCl2和dGTP的用量。表中的A表示易错PCR专用的MnCl2, B表示易错PCR专用的dGTP:
预期突变数 | 2个 | 3个 | 4个 | 5个 | 6个 | 7个 | 8个 |
A的用量(μL) | 0 | 1.0 | 2.5 | 4.0 | 4.0 | 4.0 | 4.0 |
B的用量(μL) | 0 | 0 | 0 | 1.0 | 2.0 | 3.0 | 4.0 |
- 以30 μL的标准PCR反应体系为例,如果反应体系不是30 μL,各成分需要按等比例增加或减少。在一干净的PCR管中,加入下列成分(注意:可以先计算出超纯水的用量,优先加水):
成分 | 用量 |
超纯水 | 根据第2步加 |
易错PCR Mix,10× | 3μl |
易错PCR 专用dNTP,10× | 3μl |
易错PCR 专用MnCl2 | 根据上步 |
易错PCR 专用dGTP | 根据上步 |
自备DNA模板(1ng/μL) | 1μl |
自备PCR引物(10μM each) | 1μL each |
Taq DNA聚合酶(5U/μL) | 1μl |
- 按已经优化的PCR条件进行一定循环数的PCR(循环数与突变率的关系见下表),然后取5 μL电泳检查。如果没有优化的PCR条件,一般可以先尝试下面的PCR条件(对1Kb长的模板而言):
PCR前变性 | 94℃ 3分钟 |
易错PCR(循环30次) | 94℃ 1分钟 |
45℃ 1分钟 | |
72℃ 1分钟 |
5. 电泳检测是否得到预计长度的PCR产物。
6. 克隆片段进行功能筛选、或者克隆后进行测序分析突变率、或者用此轮PCR的产物为模板,进行下一轮的易错PCR。
疑难解答:
Q:现象:没有PCR产物。
A:可能原因:一是引物没有优化,可以重新设计引物;二是模板DNA太少,可以增加用量;三是模板不纯,最好先胶回收;四是溶解DNA的溶液中有EDTA,降低了PCR反应体系的Mg离子浓度,可以适当补加Mg离子。
Q:现象:太多的PCR条带或PCR条带模糊一片。
A:可能原因:一是PCR循环数太多;二是复性温度太低;三是延伸时间太长;四是引物没有优化,可以重新设计引物;五是PCR条件没优化,可以使用touch-down PCR;六是模板有其他DNA污染;七是DNA模板质量不高或者浓度太高。
Q: 如果需要更高的突变率,如何办?
A: 可以使用连续多次易错PCR来提高突变率。但最好先用胶纯化回收PCR片段,再用于下一轮易错PCR。此外不能用少于千分之一的第一次PCR产物作为第二轮易错PCR的模板,否则多样性将受到影响。第三轮易错PCR最好使用所有第二轮的PCR产物作为模板,但需要在10mL体系中完成(可以分成很多100μL体系进行)。